วันที่ 9 กันยายน 2564 สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาตาก ได้รับรายงานจาก โรงเรียนผดุงปัญญา อ.เมือง จ.ตาก ว่าเกิดเหตุการณ์น้ำท่วมฉับพลัน ภายในบริเวณโรงเรียน เนื่องจากฝนตกหนักติดต่อกันหลายชั่วโมง ทำให้การระบายน้ำออกไม่ทัน ส่งผลให้เกิดน้ำท่วมขังไปทั่วบริเวณในตัวเมืองจังหวัดตาก รวมถึงโรงเรียนผดุงปัญญา ซึ่งเหตุการณ์ครั้งนี้ ทำให้น้ำเข้าท่วมที่ อาคารเรียน สนามฟุตบอล และบริเวณหน้าโรงเรียนในการนี้ได้เก็บเอกสารสำคัญได้ทัน และในส่วนของครุภัณฑ์และอุปกรณ์สำนักงานได้รับความเสียหายบางส่วน และอยู่ในช่วง ที่จัดการเรียนการสอนออนไลน์ ทำให้ไม่มีนักเรียน อยู่ภายในโรงเรียน